Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8C1R3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8C1R3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8C1R3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.1 ms