Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYI9

Tnr, Tenascin-R, mousemouse

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnrQ8BYI9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TnrQ8BYI9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TnrQ8BYI9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TnrQ8BYI9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms