Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp38Q8BW70 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp38Q8BW70 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
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