Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Catsper4Q8BVN3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Catsper4Q8BVN3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms