Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gga3Q8BMI3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gga3Q8BMI3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms