Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PolrmtQ8BKF1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PolrmtQ8BKF1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms