Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rufy1Q8BIJ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rufy1Q8BIJ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms