Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Susd4Q8BH32 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Susd4Q8BH32 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Susd4Q8BH32 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms