Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
U2af1l4Q8BGJ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
U2af1l4Q8BGJ9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms