Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ubash3bQ8BGG7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ubash3bQ8BGG7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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