Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Q8BGC1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8BGC1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8BGC1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8BGC1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q8BGC1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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