Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tnpo1Q8BFY9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnpo1Q8BFY9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnpo1Q8BFY9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms