Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
H2-M10.5Q85ZW7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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