Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Zbed4Q80WQ9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Zbed4Q80WQ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Zbed4Q80WQ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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Zbed4Q80WQ9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zbed4Q80WQ9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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Zbed4Q80WQ9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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Zbed4Q80WQ9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zbed4Q80WQ9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms