Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sestd1Q80UK0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sestd1Q80UK0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms