Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cep170bQ80U49 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cep170bQ80U49 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms