Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna12Q80SS5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna12Q80SS5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms