Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cdc42bpbQ7TT50 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cdc42bpbQ7TT50 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cdc42bpbQ7TT50 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cdc42bpbQ7TT50 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms