Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms