Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ube2q1Q7TSS2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ube2q1Q7TSS2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ube2q1Q7TSS2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms