Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Clec18aQ7TSQ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Clec18aQ7TSQ1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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