Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ClmQ7TSN2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ClmQ7TSN2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms