Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ppp6r1Q7TSI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ppp6r1Q7TSI3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms