Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Dsg1bQ7TSF1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Dsg1bQ7TSF1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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