Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nek5Q7TSC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nek5Q7TSC3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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