Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NexnQ7TPW1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NexnQ7TPW1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms