Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Nphp3Q7TNH6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nphp3Q7TNH6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms