Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smap2Q7TN29 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smap2Q7TN29 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms