Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Shq1Q7TMX5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Shq1Q7TMX5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Shq1Q7TMX5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms