Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ScocQ78YZ6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ScocQ78YZ6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ScocQ78YZ6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms