Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snd1Q78PY7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Snd1Q78PY7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snd1Q78PY7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms