Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Eci3Q78JN3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Eci3Q78JN3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms