Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmed3Q78IS1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed3Q78IS1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed3Q78IS1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms