Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nme8Q715T0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nme8Q715T0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nme8Q715T0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms