Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sned1Q70E20 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sned1Q70E20 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Sned1Q70E20 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms