Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Ncapd3Q6ZQK0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Ncapd3Q6ZQK0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms