Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nemp1Q6ZQE4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Nemp1Q6ZQE4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.5 ms