Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp34Q6ZQ93 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp34Q6ZQ93 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp34Q6ZQ93 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms