Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Efr3bQ6ZQ18 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Efr3bQ6ZQ18 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Efr3bQ6ZQ18 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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