Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

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Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NinlQ6ZQ12 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NinlQ6ZQ12 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NinlQ6ZQ12 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
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