Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Smpd4Q6ZPR5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Smpd4Q6ZPR5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Smpd4Q6ZPR5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms