Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc57Q6PHN1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc57Q6PHN1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms