Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rrm2bQ6PEE3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rrm2bQ6PEE3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms