Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ccdc36Q6PDM4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc36Q6PDM4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc36Q6PDM4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms