Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI6

Mindy2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-2, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy2Q6PDI6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mindy2Q6PDI6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mindy2Q6PDI6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms