Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9P0

Slf2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf2Q6P9P0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slf2Q6P9P0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slf2Q6P9P0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slf2Q6P9P0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms