Protein–RNA interactions for Protein: Q6P542

Abcf1, ATP-binding cassette sub-family F member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf1Q6P542 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Abcf1Q6P542 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Abcf1Q6P542 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcf1Q6P542 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
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