Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Paxip1Q6NZQ4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Paxip1Q6NZQ4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Paxip1Q6NZQ4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms