Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fndc3bQ6NWW9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fndc3bQ6NWW9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fndc3bQ6NWW9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms