Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tpm4Q6IRU2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tpm4Q6IRU2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms