Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ParpbpQ6IRT3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ParpbpQ6IRT3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms